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Man kann die Lebewesen in zwei große Domänen einteilen: Eukaryonten und Prokaryonten. Eukaryontisch sind alle Zellen, die im Unterschied zu Bakterien und Archäa einen Zellkern besitzen.
Man vermutet, dass die Eukaryonten sich von den Archäa ableiten, indem sie unter anderem andere Bakterien aufnahmen, die zu den mit eigner, bakterienähnlicher DNA Zellorganellen Chloroplasten und Mitochondrien wurden. In einer umstrittenen Diskussion ist, ob auch die Fortbewegungsorgane, die Flagellen, auf solche Endosymbionten zurück gehen.
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